הדוחות הכספיים של ממשלת ישראל שגובשו ע"י אגף החשב הכללי, כוללים את נתוניהם הכספיים של שישים יחידות כספיות ממשלתיות בכל משרדי הממשלה, לרבות דיווח על ביצוע התקציב בהיקף של כ- 285 מיליארד ש"ח, ומעל למאה חברות ממשלתיות. החשב הכללי, ד"ר ירון זליכה, ציין, כי דוחות כספיים אלו מהווים נדבך חשוב ברפורמה החשבונאית שמוביל אגף החשב הכללי בשלוש השנים האחרונות כחלק מהגברת השקיפות והגילוי הנאות, שעיקרה אימוץ כללי החשבונאות הבינלאומיים המקובלים וכי פרסום הדוחות הכספיים עד ל-31.3 כמקובל לגבי חברות ציבוריות מעמיד את הדיווח הכספי של ממשלת ישראל בחזית המדינות המערביות. קיצור לוחות הזמנים ופרסום הדו"ח במועד זה נעשה הודות למאמץ הרב שהשקיעו החשבים במשרדי הממשלה.

מנכ"ל משרד האוצר, ירום אריאב, ברך את החשב הכללי ונציגיו, על פרסום הדוחות שנעשו בצורה יסודית ומקצועית. אריאב ציין לחיוב את עבודת המטה שהוביל החשב הכללי ואת שיתוף הפעולה בין האגפים השונים במשרד האוצר, שאפשר, בין היתר, לעמוד בלוחות הזמנים שנקבעו ולהפיק דוחות כספיים שלמים ומקיפים. 
 
כחלק ממדיניות החשב הכללי להפוך את נתוניה הכספיים של ממשלת ישראל לשקופים, זמינים ורלוונטיים, פורסם הדוח הכספי של ממשלת ישראל לשנת 2006 על פי כללי חשבונאות מקובלים, לראשונה בסוף חודש מרץ על פי הסטנדרטים המקובלים בארץ ובעולם לחברות ציבוריות.

דוחות כספיים אלו מציגים מידע שעיקרו  נתוני ביצוע התקציב המוצגים על פי החשבות המבצעת. הצגה זו תואמת את היקף התקציב כפי שאושר על ידי הכנסת ובהתאם מאפשרת מעקב אחר ביצוע התקציב. כמו כן, הצגה זו תואמת את הנורמות המומלצות על ידי ארגון ה - OECD, שנועדה ליצור לחץ חיובי המוביל לנטילת אחריות (Accountability) של הגורמים המבצעים על נתוני הביצוע שבאחריותם. הצגה זו מאפשרת מעקב יעיל אחר ביצוע התקציב שאושר על ידי הכנסת. לצד נתוני ביצוע התקציב של כל יחידת ביצוע ממשלתית, הדוח מספק הסברים לגבי תחומי פעולה מהותיים וכן לגבי תת ביצוע מהותי.

יצוין, כי כחלק מתהליך עריכת הדוח הכספי ושיפור הדיווח הכספי של ממשלת ישראל, הורחבו השנה תהליכי הבקרה על הנתונים הכספיים וזאת באמצעות ביקורת פיננסית לבדיקת איכות ואמינות הנתונים הכספיים, על בסיס נוהל עבודה מפורט שהוכן במטה החשב הכללי.

לראשונה, הדוח כולל פרק מבוא במסגרתו ניתן ניתוח על הנתונים המאקרו כלכליים בנושאים הבאים: הגרעון הממשלתי ומימונו, מדיניות ניהול החוב הממשלתי ומדיניות ניהול הסיכונים, מידע על הפרטות וערבויות המדינה וכן מידע על התחייבות הממשלה לזכויות עובדיה.

כמו כן, בדוח מוצגים לראשונה נתונים על גירעונו של המוסד לביטוח לאומי העומד על מעל למאה מיליארד ש"ח ופירוט של סוגי התשלומים המכוסים בהתחייבות ישירה של ממשלת ישראל.

כחלק מהטיפול בנושא גביית החובות לממשלה באמצעות הקמת מנהל גביה, בדוח מוצג לראשונה ביאור ובו פירוט של היקפי החובות למשרדי הממשלה, בחתך של משרדי הממשלה.

לראשונה, הוצגו נתוני הקניין הרוחני המצוי במנהל המחקר החקלאי וזאת לאור מיפוי חשבונאי כולל בנושא שנערך במנהל המחקר החקלאי. מיפוי זה בוצע כפיילוט למיפוי כולל של כלל הקניין הרוחני שבבעלות המדינה ורישומו, לרבות קביעת ערכו הכספי (על בסיס עלות).

כחלק מהשמירה על עיקרון הרלוונטיות של הנתונים, נכללו בדוחות הכספיים עיקר החזקות המדינה בחברות ממשלתיות, על בסיס דוחותיהם הכספיים העדכניים של אותן חברות.

בשנת 2007, כחלק ממהלך כולל לשיפור הדיווח הכספי של משרדי הממשלה ולאחר בחירת משרדי רואי חשבון במכרז, יתבצע החלק הראשון בתוכנית החשב הכללי לביצוע ביקורת חיצונית של רואי חשבון על הדוחות הכספיים של ארבעה משרדי הממשלה שעברו לפעול באמצעות מרכב"ה.  

את הדוחות הכספיים הרשמיים של ממשלת ישראל ניתן לראות באתר האינטרנט של משרד האוצר בכתובת: 
http://www.ag.mof.gov.il/AccountantGeneral/AccountantGeneral/AccountantGeneralTopNav/AGSubjects/moneyinformation/Report2006