ביום ה' (17/03) נחתם הסכם ארוך טווח לביצוע שינויים מבניים ומתן תוספת תקציב , בין ד"ר אלי אופר, המדען הראשי במשרד התמ"ת לבין אגף התקציבים. בהתאם להסכם, יוגדל בהדרגה תקציב המדען הראשי, ב- 600 מיליון ש"ח: 300 מיליון ש"ח בשנת 2005, 400 מיליון ש"ח בשנת 2006 ו- 600 ממיליון ש"ח בשנת 2007 ואילך.
מתן תוספת התקציב לשנת 2005, התאפשרה בעקבות החלטת ממשלה שהתקבלה ב- 30/01/05. בהתאם להחלטה בוצעה הפחתה רוחבית בתקציבי המשרדים בשיעור של 3%. המקורות שהתפנו בעקבות ההפחתה, יועדו, בין היתר, למימון תוספת התקציב למדע"ר.
עוד סוכם כי כללי התמיכה בחברות ישונו, זאת במטרה לייעל את אופן ההקצאה ולמקד את התמיכות בפרויקטים מסוכנים בעלי ערך מוסף גבוה במיוחד למשק.
שיעור התמלוגים לחברות בינוניות וגדולות יועלה מ- 3% ו- 5%, בהתאמה כיום, ל- 4% ו- 6% בעתיד. כמו כן, בניגוד למצב הנוכחי התמלוגים ייגבו מתוך כלל הפרויקטים הנתמכים ע"י המדע"ר והריבית בגין התמלוגים תועלה לרמה של לייבור + 1%, לעומת לייבור כיום.
שינוי הכללים, יביא לכך שהחברות הבינוניות והגדולות תתמקדנה בהגשת פרויקטים מסוכנים בלבד, אשר בהתאם מתאפיינים בערך מוסף גבוה למשק.
התמלוגים הנוספים שייגבו בעקבות שינוי הכללים, יועברו לתקציב המדע"ר וישמשו לתמיכה במחקר ופיתוח.
עוד סוכם כי המדע"ר, ימשיך לפעול לייעול והפרטת החממות הטכנולוגיות. המשך התהליך יאפשר למדע"ר למקד את התמיכה בחממות מצליחות, הנהנות מליווי של קרנות הון סיכון המתמחות בהקמה ליווי וחניכה של חברות Seed.
תוספת התקציב צפויה להביא את תקציב המדען הראשי בשנת 2007 לכ- 1.8 מיליארד ש"ח (לרבות תמלוגים). השתתפות המדינה משנת 2007 ואילך תהיה גבוהה בכ- 100 מליון ש"ח ביחס לשנת השיא (שנת 2001).
ההסכם יקנה יציבות לתקציב המדע"ר, דבר אשר יאפשר לו לערוך תכנון תקציבי ארוך טווח.